La primera fase de ascenso pasa factura al club, que desde otoño de 2004 empieza a sufrir problemas de liquidez en el pago de las fichas a sus jugadores, que sin embargo, como se ha dicho, conseguirían dejar al club en cuarto lugar para disputar play-off a Segunda B. Los problemas económicos continúan la siguiente campaña, peligrando la continuidad del club en junio de 2007. Una junta gestora toma las riendas del club en verano, y consiguen sacar adelante la entidad para la campaña 2007-08 con un grupo de jugadores muy jóvenes pero motivados, a los que hay que añadir la incorporación de cuatro jugadores internacionales por el Principado de Andorra: Xavier Andorrà, Gabi Riera, camiseta japón mundial Sergi Moreno y equipacion de holanda 2022 Joan Carles Toscano.