Para la temporada 2006-07 se confió en el entrenador del filial, Félix Sarriugarte. Macua fichó varios jugadores como el portero Gorka Iraizoz, camiseta del real madrid el defensa Aitor Ocio o el centrocampista David López (entre otros) y contrató al entrenador Joaquín Caparrós. Antes de eso, el presidente Fernando Lamikiz, replicas camisetas futbol había dimitido tras la fuerte pitada que recibió al término de un partido de Liga.